1. Díaz, J.L. (1966) Bioquímica de la psicosis por anfetamina. Tesis profesional. Facultad de Medicina de la Universidad Nacional Autónoma de México, 74 pp.
2. Díaz, J.L. (1976) Indice y sinonimia de las plantas medicinales de México. México D.F, Instituto Mexicano para el Estudio de las Plantas Medicinales. Editorial Libros de México, 358 pp.
3. Díaz, J.L. (1985) Modelos de esquizofrenia y serotonina cerebral. México, Universidad Nacional Autónoma de México, 92 pp. ISBN: 968-837-459-8.
4. Díaz, J.L. (1989) Psicobiología y Conducta: rutas de una indagación. México D.F., Fondo de Cultura Económica, 311 pp. ISBN 968-16-2596-X.
5. Díaz, J.L. (1997) El ábaco, la lira y la rosa. Las regiones del conocimiento. México D.F. Fondo de Cultura Económica, Colección “La ciencia desde México”, 270 pp. ISBN 968-16-5127-8
Reediciones y reimpresiones
- 2002. Segunda edición. ISBN 968-16-6619-4.
- 2003. Primera reimpresión.
- 2011. Segunda reimpresión. ISBN 968-968-16-6619-4
6. Díaz, J.L. (2006) El revuelo de la serpiente. Quetzalcóatl resucitado. Barcelona y México, D.F., Editorial Herder, 182 pp. ISBN 968-5807-18-3.
7. Díaz, J.L. (2007) La conciencia viviente. México, D.F., Fondo de Cultura Económica, 625 pp,.
Reediciones y reimpresiones.
- Segunda reimpresión. ISBN 978-968-16-8352-8.
- Primera edición el libro electrónico 2011.
- Tercera reimpresión. ISBN 968-16-5127-8.
- Segunda edición (como José Luis Díaz Gómez). ISBN 978-607-16-5939-2 (rústico); 978-607-16-0774-4 (electrónico-epub); 978-607-16-4012-3 (electrónico-pdf).
8. Díaz, J.L. (2009): Sementeira e Memoria: Represalia e desagravio dun médico lucense republicano. Santiago de Compostela, España: Ediciós do Castro, 112 pp. ISBN: 978-84-8485-302-2.
9. Díaz, J.L. (2009) The Whirling of the Serpent. Quetzalcoatl Resurrected. Toronto, Canadá: Antares, 181 pp. ISBN: 978-1-55014-512-0
10. Díaz Gómez, J.L. (2010) Siembra y memoria. Muerte y evocación de un médico republicano. Madrid, Fondo de Cultura Económica, Biblioteca de la Cátedra del Exilio. 140 pp. ISBN: 978-84-375-0644-9.
11. Díaz Gómez, J. L. (2015) La naturaleza de la lengua. México, D.F.: Editorial Herder. 100 pp. ISBN: 978-607-7727-43-9 (México); 978-84-254-1936-2 (España).
12. Díaz Gómez, J.L. (2016) Frente al cosmos. Esbozos de cosmología cognitiva. Ciudad de México, Editorial Herder. 140 pp. ISBN: 978-607-7727-52-1 (México); 978-84-254-3353-6 (España).
13. Díaz Gómez, J.L. (2017) La naturaleza de la lengua. Discurso de ingreso a la Academia Mexicana de la Lengua 12 de junio de 2014, Respuesta de Ruy Pérez Tamayo. Ciudad de México, Universidad Nacional Autónoma de México y Academia Mexicana de la Lengua. 97 pp. ISBN:978-607-97427-5-1 (Colección AML); 978-607-02-4834-4 (Colección UNAM).
14. Díaz Gómez, J.L. (2018) Registro de sueños. Atisbos a la conciencia onírica desde las ciencias, las artes y la filosofía. Ciudad de México, Editorial Herder, 234 pp. ISBN: 978-607-7727-60-6 (México); ISBN: 978-84-254-4042-7 (España).
15. Díaz Gómez, J. L. (2020) Las moradas de la mente. Conciencia, cerebro, conducta. México, Fondo de Cultura Económica y Universidad Nacional Autónoma de México, 542 pp. ISBN: 978-607-16-6969-8 (FCE); 978-607-30-3661-0 (UNAM).
16. Díaz Gómez, J.L. (2021) El enredo mente ~ cuerpo. México: Editorial Herder. Libro electrónico. ISBN: 978-607-7727-86-6.
17. Díaz Gómez, J.L. (2022) Neurofilosofía del yo. Autoconciencia e identidad personal. Ciudad de México: Bonilla Artigas Editores y Universidad Nacional Autónoma de México (Programa Universitario de Bioética), 415 pp. ISBN: 978-607-8838-19-6 (Bonilla Artigas); 978-607-30-613-6 (UNAM/PUB).
